与东线战事一样，北线战事也是曲折坎坷。
起初卢植率军与黄巾军盘踞在冀州的主力交战数次，大败张角，斩杀数万人，士气高昂，一路凯歌，大有一举扫平黄巾军北线主力的态势。
不过情况并不如卢植想的那样简单，张角何许人也，怎么可能因为野战失败而丧失实现自己理想的信心呢。张角立刻改变战略方针，收缩战线，屯兵于广宗（今河北邢台），固守不战，以此来争取外援，等待时机。卢植竟三个月久攻不下，转而包围城池，挖掘壕沟，就地打造攻城器械，准备一鼓作气攻下广宗。
似乎攻下广宗是十拿九稳的事了，需要的只是时间，但是时间却不会等人。就在这个时候，一个厄运降临到卢植的头上。
大军外出征战，皇帝或多后少总是会猜忌的，灵帝也不例外。刚好刘宏就派了小黄门(中级太监）左丰到卢植军中视察工作，看看有没有聚众谋反啊，还是聚众赌博什么的。灵帝贪婪敛财，下面的宦官们更是贪赃枉法，左丰到了卢植军中，就开始琢磨怎么敛财，不断暗示卢植行贿，卢植假装糊涂，敷衍过去，手底下人一看，便劝卢植向左丰行贿，这样才能官运亨通。卢植正声厉色，我忠君报国，两袖清风，所的财物尽皆激赏士卒，何来行贿之物，此为君子所不齿。左丰吃了闭门羹，心里想你卢植让我白走一趟，我就让你吃苍蝇，不好过。
左丰很快返回洛阳，立马就向刘宏汇报说，陛下，这广宗一马平川，尤其好打，可是卢植却天天纵酒行乐，不思进取，按兵不动，有聚众谋反的嫌疑，还辱骂使者，这就在打皇帝的脸啊。刘宏除了亲妈，最信的就是宦官，不由分说立刻下令将卢植逮捕，用囚车押回洛阳，入狱论罪，判处无期徒刑。
朝廷又拜董卓为东中郎将，率军攻打广宗，反被张角大败于宜阳（今河南宜阳县）。从此北线战事不容乐观。
再说南线战场，南阳太守秦颉与张曼成战斗，斩杀了张曼成。黄巾军便改以赵弘为帅，以十多万人占据宛城。朱儁与荆州刺史徐璆及秦颉共一万八千精兵围攻赵弘，黄巾军死守不战，两月不下。朱儁见坚城难以攻破，便以退为进，假装粮尽退兵，露出破绽，黄巾军果然中计，轻敌冒进，反而中了朱儁埋伏，主力被歼灭，赵弘被杀，韩忠率残部退守宛城，终因寡不敌众，投降中央。秦颉一向与韩忠不和，便公报私仇，将他杀死。这举动反令黄巾军不安，又推孙夏为帅，孙夏败退至精山（今河南南阳），被汉军追上，孙夏被杀，盘踞在宛城黄巾军南线主力至此被全部歼灭，朱儁于次年春天班师回朝。
另一方面，皇甫嵩到达东郡仓亭，大破、生擒卜己，斩杀七千多人。东线战事平定，恰逢北线紧急，遂挥师北进。
就在皇甫嵩兵临广宗城下时，一代天师张角病死了，黄巾军失去了核心领导人，感到前途渺茫，士气衰落。皇甫嵩趁敌军放松懈怠之际发动夜袭，黄巾军仓促应战，张梁以下三万多人被杀，自相践踏，溺死者达五万多人，广宗失守。张宝独木难支，皇甫嵩联合巨鹿太守郭典攻打黄巾军最后的据点曲阳（今河北保定），曲阳陷落，张宝被杀，十万多人被俘。
至此，黄巾之乱平息，但起义的星火再难熄灭，东汉不过苟延残喘而已了。
从公元184年二月至十一月，九个月间黄巾主力被彻底摧毁，起义失败，十几年的准备旦夕间就付诸东流，究竟是什么原因让这个农民斗地主的游戏这么快就OVER了呢？可以说，原因很复杂，细细想来，总结如下：
其一、黄巾军不懂得战争的游戏规则。只知道单干耍横，都以为其他的友军都是猪一样的队友，不愿意互相配合。其实这世上最可怕的不是神一样的对手，也不是猪一样的队友，而是死猪一样的战友。这个世界上没有战无不胜的个体，一时的个人崇拜最终也是没有好下场的，战神项羽之所以最后败给地痞刘邦也源于此。
其二、黄巾军“病入膏肓”。张角的过早离世，使得黄巾军失去了核心凝聚力，失去了士气，也就失去了战斗力，更重要的是黄巾军忘记了起义的缘由和致胜的根本，有如得了老年痴呆一般，摒弃了赖以生存的群众基础，所作所为与“致太平”的思想背道而驰，张角是他们的理想归宿，一旦精神空虚，就完全沦为一帮群龙无首的土匪。尽管官军那也是土匪一般，但百姓觉得没文化的土匪要更加可怕。
其三、黄巾军饮鸩止渴，自作孽，不可活。黄巾军没有严密的军事化管理和完善的经济规划体制，几乎就沦为得过且过的乞丐。打仗从来都是拖家带口，没有明确的分工，虚耗军资，扩大地盘的同时不能及时的利用生产资料开展生产，得不到民心那只能发展为不可持续的恶性循环，实力是越打越弱，信心是越打越虚，到最后心理防线彻底崩溃，战局可想而知。
不过说理归说理，人情也是要讲的，从人性求生的本能和反抗剥削压迫的革命性质而言，黄巾大起义是值得肯定的，鲁迅不是说，要么在沉默中爆发，要么在沉默中死去，与其受压迫而死，为什么不拼死一搏呢，哪怕是要不了你的一条命，也要让你只剩半条命。
客观上说，黄巾起义虽然在军事上是失败了，但在政治上却是成功的，因为正是黄巾之乱让汉灵帝自食恶果，改刺史为州牧，从实质上和名义上承认了各地方政府的自治，于是地方势力急速演化成为中央政府尾大不掉的割据势力，东汉朝廷俨然成为了那春秋战国时期的东周天子，名存实亡，只能号令猪猴，而不能号令诸侯了。